วัดโดเมียวจิสร้างขึ้นในปี 594 (ซุยโกะ 2) โดยฮาจิโนะมูระ ยาชิมะ เพื่อเป็นวัดประจำครอบครัว กล่าวกันว่ารูปปั้นพระโพธิสัตว์เจ้าแม่กวนอิม 11 เศียรซึ่งเป็นสมบัติประจำชาตินั้นถูกแกะสลักด้วยมือโดยท่านมิจิซาเนะ ซึกะวาระขณะอยู่ที่วัด ในปี 901 (เอนกิ 1) เมื่อเจ้าชายมิจิซาเนะถูกลดตำแหน่งเป็นดาไซฟุ เขาได้ไปเยี่ยมชมวัดแห่งนี้และรู้สึกเสียใจที่ต้องแยกทางกับคาคุจูนิ ป้าของเขา ซึ่งเป็นหัวหน้าบาทหลวง เป็นข้อเท็จจริงทางประวัติศาสตร์ที่เมื่อเขาถูกลดตำแหน่งเป็นดาไซฟุ เขาเสียใจที่พูด ลาก่อนป้าคาคุจูนิซึ่งเป็นหัวหน้านักบวช ปรากฎใน "เด็นจู เท นาระ คากามิ" ผงโดเมียวจิซึ่งมีชื่อเสียงในฐานะส่วนผสมของซากุระโมจิเริ่มต้นขึ้นเมื่อมิจิซาเนะหลังจากถูกลดตำแหน่งเป็นดาไซฟุ ก็ได้ทำให้แห้งและเก็บที่เหลือจากโกะเซ็นที่คาคุจูนิถวายทุกวันเพื่อแบ่งปันกับคนจำนวนมาก หลังจากมิจิซาเนะเสียชีวิต ชื่อวัดก็เปลี่ยนเป็นชื่อของมิจิซาเนะ ``โดเมียว'' และกลายเป็น ``โดเมียวจิ''