นอกจากศาลเจ้าหลักซึ่งได้รับการกำหนดให้เป็นทรัพย์สินทางวัฒนธรรมที่สำคัญของชาติแล้ว ศาลเจ้าฟุนาโมริยังมีห้องสักการะ สถานที่สักการะของศาลเจ้า เวที และศาลเจ้ามิโคชิอีกด้วย รายละเอียดเช่นการก่อสร้างยังไม่ได้รับการเปิดเผย ในบริเวณพื้นที่ ต้นการบูรที่มีรูปร่างผิดปกติซึ่งมีลำต้นสี่ต้นเชื่อมติดกันนั้นได้รับการบูชาเป็นต้นไม้ศักดิ์สิทธิ์ ต้นไม้ต้นนี้มีอายุประมาณ 800 ปี และถูกกำหนดให้เป็นอนุสรณ์สถานทางธรรมชาติโดยจังหวัด