วัดชินกันจิสร้างขึ้นในช่วงปลายยุคอะซูจิ-โมโมยามะในสมัยบุนโรคุภายใต้โทโยโทมิ ฮิเดโยชิ แต่ถูกทำลายหลังการล้อมฤดูหนาว และในปี 1622 ด้วยความช่วยเหลือจากตระกูลอุนโนะ ซึ่งเป็นบรรพบุรุษของตระกูลซานาดะ จึงได้ถูกสร้างขึ้นในโอซาก้า สร้างขึ้นใหม่ในบริเวณสถานที่ตั้งแคมป์ฤดูหนาว (ซานาดะ มารุ) เพื่อเป็นอนุสรณ์สำหรับซานาดะ ยูกิมูระและไดสุเกะ ลูกชายของเขา ใกล้กับวัดชิงกันจิคือตำแหน่งที่นายพลซานาดะ ยูคิมูระ (ซานาดะซาเอมอนสะ โทโยโทมิ โนบุชิเกะ) ผู้มีชื่อเสียงได้สร้างป้อมที่เรียกว่าซานาดะ มารุทางตะวันออกเฉียงใต้ของปราสาทโอซาก้าบนที่ราบสูงคามิมาจิ ซึ่งฝ่ายของโทโยโทมิอ่อนแอในช่วงการรณรงค์ฤดูหนาว นอกจากนี้ ในปี ค.ศ. 1867 การฆาตกรรมเรียวมะ ซากาโมโตะและชินทาโร นากาโอกะที่ร้านอาหารโอมิยะในคาวารามาจิ เกียวโต เกี่ยวข้องกับสมาชิกหลายคนของกลุ่มเกียวโตมิมาวาริ รวมถึงฮายาโนะสุเกะ คัตสึระ, โยชิทาโร วาตานาเบะ และยาสุจิโระ ทาคาฮาชิ ซึ่งทำให้เกิดความสนใจมากยิ่งขึ้น . ตา. มิมาวาริกุมิยังเข้าร่วมในยุทธการโทบะ-ฟูชิมิด้วยและเสียชีวิตในการรบ และถูกฝังไว้ที่วัดชินเก็นจิ ซึ่งหลุมศพของพวกเขายังคงอยู่